MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 7694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012943	CGG	2	6	3405373	3405378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_012943	CTG	2	6	3405393	3405398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_012943	GCA	2	6	3408058	3408063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_012943	TCA	2	6	3408067	3408072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_012943	GC	3	6	3408079	3408084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_012943	GAC	2	6	3408099	3408104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_012943	C	6	6	3408124	3408129	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6008	NC_012943	CAG	2	6	3408138	3408143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_012943	GTC	2	6	3409183	3409188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_012943	TGC	2	6	3409205	3409210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_012943	GCC	2	6	3409551	3409556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_012943	GGGGT	2	10	3412595	3412604	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_012943	CG	3	6	3412624	3412629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_012943	GC	3	6	3412644	3412649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_012943	TGA	2	6	3412659	3412664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_012943	TGC	2	6	3414199	3414204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_012943	CCG	2	6	3415458	3415463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_012943	TCACG	2	10	3415480	3415489	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6019	NC_012943	GTT	2	6	3415507	3415512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_012943	CGC	2	6	3415553	3415558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_012943	TG	3	6	3415614	3415619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_012943	C	6	6	3418135	3418140	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6023	NC_012943	AGC	2	6	3418195	3418200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_012943	GTCG	2	8	3418311	3418318	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6025	NC_012943	GCC	2	6	3418342	3418347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_012943	CGT	2	6	3422084	3422089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_012943	AGTCC	2	10	3424828	3424837	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6028	NC_012943	ATC	2	6	3424853	3424858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_012943	CGTGG	2	10	3424918	3424927	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6030	NC_012943	GTC	2	6	3424995	3425000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_012943	GC	3	6	3425066	3425071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_012943	CTA	2	6	3425360	3425365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_012943	CG	3	6	3425391	3425396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_012943	CGG	2	6	3425412	3425417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_012943	AGC	2	6	3425802	3425807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_012943	AC	3	6	3425839	3425844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_012943	GAT	2	6	3425921	3425926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_012943	CCA	2	6	3429316	3429321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_012943	CGC	2	6	3429390	3429395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_012943	GAG	2	6	3430701	3430706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_012943	ACG	2	6	3433093	3433098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_012943	GCCG	2	8	3433117	3433124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_012943	CAG	2	6	3433134	3433139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_012943	GTG	2	6	3433140	3433145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_012943	CCAC	2	8	3433168	3433175	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6046	NC_012943	CAT	2	6	3433195	3433200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_012943	CGC	2	6	3433201	3433206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_012943	TGCC	2	8	3433510	3433517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_012943	CGT	2	6	3433636	3433641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_012943	CCG	2	6	3433695	3433700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_012943	CGT	2	6	3433728	3433733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_012943	TGA	2	6	3433774	3433779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_012943	TGC	2	6	3433789	3433794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_012943	GGCC	2	8	3433833	3433840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_012943	CT	3	6	3435913	3435918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_012943	CGGC	2	8	3435949	3435956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_012943	GCC	2	6	3438234	3438239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_012943	CAT	2	6	3438261	3438266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_012943	CGA	2	6	3439472	3439477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_012943	CGC	2	6	3441475	3441480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_012943	CTC	2	6	3441481	3441486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_012943	TAC	2	6	3441532	3441537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_012943	CGC	2	6	3441588	3441593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_012943	ACG	2	6	3441596	3441601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_012943	GCC	2	6	3441627	3441632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_012943	GGA	2	6	3441724	3441729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_012943	GTC	3	9	3443575	3443583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_012943	GCG	2	6	3443598	3443603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_012943	CGGCG	2	10	3443630	3443639	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6070	NC_012943	CAC	2	6	3443668	3443673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6071	NC_012943	AGA	2	6	3444133	3444138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_012943	TCG	2	6	3444189	3444194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_012943	GCC	2	6	3444195	3444200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_012943	TAC	2	6	3446071	3446076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_012943	CCCT	2	8	3446212	3446219	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6076	NC_012943	TCCA	2	8	3446239	3446246	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_012943	CCA	2	6	3446286	3446291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_012943	CCG	2	6	3446295	3446300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_012943	CGT	2	6	3446344	3446349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6081	NC_012943	GGC	2	6	3449102	3449107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_012943	CGT	2	6	3450832	3450837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_012943	CGA	2	6	3450868	3450873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_012943	ACC	2	6	3450878	3450883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6085	NC_012943	CGGC	2	8	3450900	3450907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6086	NC_012943	TTC	2	6	3450989	3450994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_012943	CGA	2	6	3451042	3451047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_012943	CG	3	6	3451051	3451056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6089	NC_012943	TCGT	2	8	3451091	3451098	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_012943	GGC	2	6	3451135	3451140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_012943	GCGCG	2	10	3451228	3451237	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6092	NC_012943	GCC	2	6	3451250	3451255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6093	NC_012943	ACCG	2	8	3451332	3451339	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6097	NC_012943	GC	3	6	3451456	3451461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6098	NC_012943	GCC	2	6	3451502	3451507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_012943	GGT	2	6	3451525	3451530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6101	NC_012943	TGG	2	6	3451560	3451565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6109	NC_012943	CGA	2	6	3451776	3451781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_012943	GAG	3	9	3451798	3451806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_012943	CCG	2	6	3451822	3451827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_012943	CGA	2	6	3451829	3451834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_012943	GAG	3	9	3451851	3451859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_012943	TGAC	2	8	3451869	3451876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6115	NC_012943	CTT	2	6	3457008	3457013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_012943	GTTG	2	8	3457062	3457069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6121	NC_012943	GTC	2	6	3460913	3460918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_012943	CGGGC	2	10	3462616	3462625	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6123	NC_012943	GGTGC	2	10	3467106	3467115	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6124	NC_012943	TTG	2	6	3467156	3467161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_012943	GTT	3	9	3467187	3467195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_012943	TCG	2	6	3467204	3467209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_012943	CCA	2	6	3467281	3467286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6129	NC_012943	GAT	2	6	3467754	3467759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6252	NC_012943	GC	3	6	3520009	3520014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6253	NC_012943	AC	3	6	3520053	3520058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6254	NC_012943	GGC	2	6	3520098	3520103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6255	NC_012943	GC	3	6	3531999	3532004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6256	NC_012943	CGG	2	6	3532024	3532029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6257	NC_012943	CAC	2	6	3536180	3536185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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